海军航空工程学院是有2个校区的。

　　海军航空大学有2个校区,分别为本部和青岛校区,本部地址为山东省烟台市芝罘区二马路188号、青岛校区地址为二马路188号。中国人民解放军海军航空大学，始建于1950年，坐落于山东省烟台市，由海军航空兵学院和海军航空工程学院重组而成，是一所以培养海军航空兵和岸防兵初中级指挥军官、飞行军官、参谋军官、空中战勤军官和航空航天工程技术军官为主的高等军事院校。

　　该校是海军指挥与工程技术人才培养的主要基地和航空航天领域科研中心之一，是海军航空兵、岸防兵战斗力建设的重要源头。据2017年海军航空工程学院博士研究生招生简章显示，学校本部驻山东烟台市区，在青岛设校区和航空训练基地，占地总面积5300余亩。这是一所历史悠久、底蕴深厚的院校。海军航空大学由两所历史悠久、文化底蕴深厚的院校重组而成。海军航空兵学院，成立于1950年11月1日,主要担负海军航空兵初中级指挥军官、飞行军官、参谋军官、空中战勤军官等培养任务，是海军航空兵战斗力建设的重要源头，是全军唯一担负航母舰载机飞行人员培养任务的院校。

　　海军航空工程学院，创建于1950年8月24日，是新中国首批组建的军事院校之一，主要培养海军初级指挥军官、航空航天工程技术军官为主的高等军事院校，1979年被国务院列入全国重点高等院校，1986年获硕士学位授予权，2000年获博士学位授予权，2003年建立博士后科研流动站，2000年、2010年两次被总部授予“全军院校教学优秀单位”。

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